流式細胞分析技術是一門定量分析的方法學，透過液流帶動懸浮樣本通過雷射光，當細胞通過雷射時，激發標定於細胞上的螢光物質，最終偵測螢光訊號與散射光，反映出樣本特性，達到鑑別特殊細胞族群等目的。因為使用液流系統推動樣本，每秒鐘可偵測到數千至萬顆細胞，屬於高通量分析方法，也非常適合分析稀有細胞族群。流式細胞儀可應用於各式各樣的分析實驗中，例如標定細胞表面抗原的免疫分型實驗、胞內抗原分析、測定細胞內部DNA含量、細胞週期、細胞增生與凋亡試驗、外泌體檢測等，甚至可以使用流式測定蛋白質的絕對濃度，以下將替大家說明幾種常見的應用。
1.免疫分型 (Immunophenotyping)
免疫分型為流式細胞儀中最常見的應用，透過偵測免疫細胞上特異性抗原或是抗原組合，作為標誌 (Marker)，例如T細胞同時表現CD45與CD3；而B細胞則帶有CD45與 CD19，透過這些特有的標誌，協助我們從樣本中找出目標細胞群。
圖二、6色分析全血中淋巴球細胞
此類型實驗在過去已累積很多的經驗，有許多細胞分群與多色螢光配置的資訊刊載於Cytometry Part A期刊，尤其是Optimized Multicolor Immunofluorescence Panel (OMIP) 專刊，這些多色實驗結果已經過驗證和發表，是開發各種免疫應用的公開分享資源，可作為實驗設計的參考。
